Als de prostaat erg vergroot is, is endoscopische behandeling (lasertherapie, TUR-P) in sommige gevallen niet meer mogelijk. In dat geval is een open prostaatoperatie via een incisie in de buik (suprapubische prostaat enucleatie (SPE)) een optie. Bij dit type operatie wordt de blaas geopend via een incisie in de onderbuik. De chirurg gebruikt dan een vinger om de goedaardig vergrote delen van de prostaat te verwijderen. Vervolgens moet de urine gedurende 10 dagen via een katheter worden afgevoerd totdat de blaas is genezen.
Suprapubische prostaat enucleatie is een relatief grote chirurgische ingreep met bijbehorend bloedverlies en is vooral belastend voor oudere patiënten. De potentie blijft meestal behouden. Het sperma stroomt echter terug in de blaas tijdens de ejaculatie (zogenaamde retrograde ejaculatie of droge ejaculatie).
Dankzij moderne vormen van resectie (TURiS) en laserverdamping is de procedure nu meestal overbodig, omdat prostaatvolumes tot 200 cc nu zonder problemen transurethraal (via de plasbuis) kunnen worden behandeld.